Your Ad Here



Gedung Ilmu
Orang berilmu adalah bagai sebuah rumah yang dipenuhi
dengan buku-buku dan rak-rak buku. Dia dapat memimpin dirinya untuk
melakukan pekerjaan yang terbaik dengan cara yang terbaik, dengan izinNya. Orang berilmu
yang sentiasa mengajarkan ilmunya kepada orang lain pula adalah bagai sebuah
perpustakaan yang kebaikannya dapat dimanfaatkan oleh dirinya dan para
ilmuan yang mahu memperbaiki diri mereka.








Ke Gedung Ilmu





Seruan para Nabi dan Rasul Sepanjang zaman dari Nabi Adam Alaihis Salam sehingga Nabi Muhammad Sallallahu Alaihi Wassalam:

Quluu, "Laa ilaaha illallah"
Katakanlah, "Tiada Tuhan selain Allah"
Say, "No God but Allah"








Formula Menuntut Ilmu
  • Mesti wujudkan minat yang mendalam
  • Belajar dan cari ilmu melalui pembacaan buku
  • Ijtihad (berfikir) dengan mendalam tentang sesuatu yang dipelajari
  • Hormat guru semoga dapat berkat
  • Korban masa dan tenaga
  • Korban wang ringgit

Tip-tip Belajar Cemerlang

Petua kecemerlangan Nur Asyikin dalam NUA:
- Hormat dan berbuat baik kepada ibu-bapa (bila berbuat salah cepat-cepat minta maaf) .... Dan sesungguhnya Allah tidak mensia-siakan pahala orang-orang yang berbuat baik (Ayat Al-Quran).
- Usaha, tekun dan tawakkal formula untuk berjaya

Doa:
1. Doa jangan malas
2. Doa terang hati - Selalu baca surah Al-Insyirah (Alam nashrah)
- Allahumma zidni ilman waal hikni bisslalihin.
- Allahumma nawwir qalbi. Binuri hidayatik. Kama nawartal ardha. Binuri syamsika. Abadan abada.

Sikap:
1. Menyukai kursus dan menyukai pensyarah. Hindarkan daripada membentuk tanggapan negatif terhadap keduanya.
2. Sangka baik terhadap Allah, iaitu Allah memeperkenankan doa, setiap kali kita berdoa.
3. Sentiasa bersikap positif.
- Setelah belajar dan berdoa, pejamkan mata dan banyangkan yang anda sedang menjawab soalan dan dapat menjawab dengan tepat setiap soalan.
- Setiap kali bangun dari tidur, pejamkan mata dan banyangkan yang anda menerima slip peperiksaan dengan tersenyum kerana semua subjek yang anda ambil anda dapat "A".
- Dengan cara ini, insya-Allah, minda anda, enzyme, hormon dan semua sistem fisiologi, biokimia, sikologi anda akan menyediakan diri anda ke arah kecemerlangan. Sebaliknya, jika anda ragu-ragu, sistem yang ada dalam diri anda akan menyeidakan diri anda ke arah kegagalan.

Wallahu aalam

   

<< October 2009 >>
Sun Mon Tue Wed Thu Fri Sat
 01 02 03
04 05 06 07 08 09 10
11 12 13 14 15 16 17
18 19 20 21 22 23 24
25 26 27 28 29 30 31


If you want to be updated on this weblog Enter your email here:



rss feed

My other blogs: Purplemelastoma
Alur Ilmu


Senarai Surah-Surah
dalam Al-Quran


Petik nama surah untuk
membaca makna

1) Al-Faatihah

2) Al-Baqarah

3) A-li'Imraan

4) An-Nisaa'

5) Al-Maaidah

6) Al-An'aam

7) Al-A'raaf

8) Al-Anfaal

9) At-Taubah

10) Yunus

11) Hud

12) Yusuf

13) Ar-Ra'd

14) Ibrahim

15) Al-Hijr

16) Al-Nahl

17) Al-Israa'

18) Al-Kahfi

19) Maryam

20) Taha

21) Al-Anbiyaa'

22) Al-Hajj

23) Al-Mu'minuun

24) An-Nuur

25) Al-Furqaan

26) Asy-Syu'araa'

27) An-Naml

28) Al-Qasas

29) Al-'Ankabuut

30) Ar-Ruum

31) Luqman

32) As-Sajdah

33) Al-Ahzaab

34) Saba'

35) Faatir

36) Yaa Siin

37) As-Saaffaat

38) Saad

39) Az-Zumar

40) Ghaafir

41) Fussilat

42) Asy-Syuura

43) Az-Zukhruf

44) Ad-Dukhaan

45) Al-Jaathiyah

46) Al-Ahqaaf

47) Muhammad

48) Al-Fat-h

49) Al-Hujuraat

50) Qaaf

51) Adz-Dzaariyaat

52) At-Tuur

53) An-Najm

54) Al-Qamar

55) Ar-Rahmaan

56) Al-Waaqi'ah

57) Al-Hadiid

58) Al-Mujaadalah

59) Al-Hasy-r

60) Al-Mumtahanah

61) As-Saff

62) Al-Jumu'ah

63) Al-Munaafiquun

64) At-Taghaabun

65) At-Talaaq

66) At-Tahriim

67) Al-Mulk

68) Al-Qalam

69) Al-Haaqqah

70) Al-Ma'aarij

71) Nuh

72) Al-Jinn

73) Al-Muzzammi

74) Al-Muddaththir

75) Al-Qiaamah

76) Al-Insaan

77) Al-Mursalaat

78) An-Naba'

79) An-Naazi'aat

80) 'Abasa

81) At-Takwiir

82) Al-Infitaar

83) Al-Mutaffifiin

84) Al-Insyiqaaq

85) Al-Buruuj

86) At-Taariq

87) Al-A'laa

88) Al-Ghaasyiya

89) Al-Fajr

90) Al-Balad

91) Asy-Syams

92) Al-Lail

93) Adh-Dhuha

94) Ash-Syar-h

95) At-Tiin

96) Al-'Alaq

97) Al-Qadr

98) Al-Bayyinah

99) Az-Zalzalah

100) Al-'Aadiyaat

101) Al-Qaari'ah

102) At-Takaathur

103) Al-'Asr

104) Al-Humazah

105) Al-Fiil

106) Quraisy

107) Al-Maa'uun

108) Al-Kauthar

109) Al-Kaafiruun

110) An-Nasr

111) Al-Masad

112) Al-Ikhlaas

113) Al-Falaq

114) An-Naas


Blog Index

Menjadi Pelajar Siswazah
[1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10]

Biologi Sel


Mikrobiologi

[1] [2] [3] [4] [6] [7] [8] [9] [10]


Imunologi

[1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10]

Berfikir Untuk Berjaya
[1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10]

Asam Garam Kehidupan


Mencari Jodoh

Kita hanya berusaha. Yang menentukannya hanyalah Allah


Artikel-Artikel Rujukan Dalam Menangani Asam Garam Kehidupan




Sukan dan Riadah


Kerohanian

Sains


Rencam




JALAN-JALAN CARI RESIPI

EDUCATIONAL LINKS & INFORMATION

Microbiology Resources
Microbiology Resources
Scientific Communication Resources
Immunology Resources
Personal Development
Al Quran On-line
Universiti-Universiti di Malaysia
Hit Counter by Digits
Mula April 2008





Terkenang

Kita terkenang pada sesuatu peristewa
Kerana peristewa itu penting dalam sejarah hidup
Manis atau pahitnya pahit peristewa bukan ukuran
Asalkan ia mencorakkan hidup masa depan kita
Kita terkenang pada sesuatu yang kita tidak dapat padanya
Mengira-ngira bangaimana sesuatu yang diimpikan luput dari genggaman
Kekadang berangan-angan bagaimana rasanya jika sesuatu yang luput itu dipunyai
Pejamkan mata, tergambar indahnya suasana dialam maya
Namun fikiran waras kita kerap melebihi angan-angan
Lalu kembali berpijak di alam nyata...syukur.
Kita terkenang pada sesuatu yang berlalu di masa lampau
Kerana tidak mungkin kita kembali pada masa dan tempat yang sama
Kerana yang dikenang itu sudah berubah dan kitapun berubah juga, kekadang tiada
Jadi, mengapakah kita masih mahu mengenang perkara yang lepas itu?
Mengapakah tidak terlintas di hati untuk mengenang masa-masa mendatang?
Hmmm.... bolehkah kita mengenang sesuatu yang belum berlaku?

Ogos 2008


Bahtera di lautan bergelora

Bahtera belayar di lautan bergelora
duapuluh lima nakhoda silih berganti
mengemudi bahtera di paksi yang satu
berzaman lamanya pada arahtuju yang lurus
persis pada titian siratal mustaqim

Walau dilambung gelombang setingi gunung
walau dipukul ribut taufan yang meranap segala
walau diserang berjuta naga dan jerung yang ganas
walau dirompak lanun yang membunuh setiap yang bernyawa
namun bahtera tetap pada paksinya itu

Ramai sudah pelayar yang kecundang
mereka yang terjatuh dek tipu daya pemujuk daif
mereka yang terjun memilih fatamorgana
tertipu dek gamitan bahtera-bahtera gah lagi perkasa
dilengkapi keselesaan dan makanan untuk berpesta menjamin keseronokan yang sementara
tanpa ketakutan dan keputusan bekalan
hanya belayar di lautan tanpa tujuan hakiki
besarnya kapal menjadi ukuran
tidak mungkin karam sampai bila-bila

Wahai penghuni bahtera ini
yang datangnya dagang perginya pun dagang
singgah sementara di alam buana yang fana
inilah wadah pelayaran yang hakiki
jangan terhina dengan daifnya bahtera ini
yakinkan diri pada lurus arahtujunya
melalui perjalanan dengan matlamat yang jelas
semoga tiba dipenghujung alam
dengan berbekalkan hati yang sejahtera
bertemu dengan yang Maha Pencipta

free counters

Mula 2 Februari 2009

Genap 3 tahun pada 2 Februari 2012
(bacaan counter = 14,913)


Senyuman Yang Indah

Senyuman yang indah
Mekar di kelopak bibir
Jelmaan hati yang ikhlas
Mencermin budi pekerti yang luhur
Sedekah yang sangat bererti
Bukan manisnya jadi ukuran
Keikhlasan satu tuntutan
Mesra sesama insan
Wacana hati yang sejahtera
Sinar tulus hati
Bukan untuk menggoda
Bukan dibuai nafsu rakus
Bukan sinis beracun
Suka duka dilindungi
Wajah muram dilakarkan seri
Nukilan rasa hati
Kelak...
Senyuman yang indah
Terukir di pagi hari

10 Disember 2001

Mencari Erti Hidup

Apa ertinya hidup bagi yang serba kekurangan?
Apa erti hidup jika tidak sempurna?
Apa erti hidup jika merempat?
Apa erti hidup jika sentiasa gagal?
Keluhan yang kekurangan
Siang dan malam mempersoal
Apa yang diharapkan pada esok!

Apa ertinya hidup bagi yang kaya raya?
Hidup ini adalah padang bersuka ria
Dialah manusia yang paling bahagia
Dunia di dihati menguasai gerak geri
Hidup ini segala-gala yang dicita
Siang dan malam memuji
Pandainya diri!
Pabila mati lenyaplah diri

Apakah tubuh yang hancur itu tandanya manusia itu mati?
Tidak!
Manusia tidak mati selama-lamanya
Hidup mati hanyalah tanda perpindahan alam
Hidup di dunia adalah padang ujian
Hidup di akhirat adalah padang penilaian
Siapa di antara manusia yang baik amalannya
Bagi yang memahami erti mati, dunia di tangan bukan di hati
Sentiasa bersyukur pada yang ada
Memahami rezki diberi mengikut kadarnya
Membelanjakan harta berpada-pada
Hanya menuntut keredaanNya

2005





Lagu Terbaik Universiti Tempatan




UNIMAS Gemilang




Unimas Gemilang





Terciptalah Suatu Sejarah
Wujudmu di Persada Negara
Di Bumi Kenyalang Bertuah
Kebanggaan Nusa dan Bangsa







Berinovasi dan Berwawasan
Berilmu Berpandangan Jauh
Inilah Hasrat dan Harapan
Kamilah Pendukung Warisan






Teguh Terunggul Namamu

UNIMASku yang Gemilang

Dengan Penuh Keikhlasan

Kami Wargamu di Sini

Berbangga....







Berbudaya,Bersifat Sezaman
Bersatu Hati Mencurah Bakti
Jasamu, Tiada Bandingan
Kau Disanjung dan Dihormati






Wajahmu Tak Kan Rami Lupakan
Sentiasa Terpahat di Ingatan
Menjadi Lipatan Sejarah
Segar Mekar Dalam Kenangan







Teguh Terunggul Namamu

UNIMASku yang Gemilang

Dengan Penuh Keikhlasan

Kami Wargamu di Sini

Berbangga.. ...




UNIMAS Gemilang .....








UKM - Varsiti Kita







UMS - Bertekad Gemilang





Friday, October 09, 2009
Mikobiologi Asas (6)



3.2. Pertumbuhan Populasi

Pertumbuhan populasi bermaksud penambahan bilangan sel dalam sesuatu kultur bakteria. In melibatkan pembahagian sel secara belahan dedua (binary fission) Proses pembahagian sel bakteria berlaku dalam jangka masa yang berbeza beza bergantung pada beberapa faktor seperti spesies bakteria, pH, suhu, kandungan nutrien dan kewujudan atau ketiadaan oksigen. Kadar pertumbuhan bakteria berbeza secara intrinsik. Terdapat spesies bakteria yang melipatganda dengan cepat, sederhana dan lambat. Contoh satu bakteria yang sangat cepat membiak ialah E. coli, yang sederhana ialah Agrobacterium dan Pseudomonas dan yang lambat ialah Mycobacterium.

Istilah masa mendua sering digunakan untuk menyatakan masa yang diambil bagi pembahagian satu sel kepada dua sel, daripada dua kepada empat, daripada empat kepada lapan dan seterusnya. Masa mendua ini juga disebut sebagai masa generasi. Masa generasi bagi E. coli dalam keadaan medium dan sekitaran yang optimum adalah antara 15-30 minit.

Jika dibandingkan dengan bakteria yang lain, seperti Mycobacterium tuberculosis, masa generasi untuk E. coli ini sangat cepat. Mengikut kajian yang telah dilakukan medium yang paling sesuai bagi M. tuberculosis hanya boleh mendapatkan masa generasi 15-30 jam.

Di atas medium pertumbuhan agar-agar yang telah diinokulasi dengan bakteria, mungkin terdapat satu sel bakteria yang terpisah. Sel yang terpisah ini tidak boleh dilihat dengan mata kasar, tetapi setelah beberapa jam maka satu koloni yang terbit daripada pembahagian dan penambahan sel-sel baru akan kelihatan di atas agar agar itu. Koloni atau kumpulan kumpulan sel ini mengandungi beribu- ribu sel sebelum boleh dilihat dengan mata kasar. Sel sel ini terus membahagi untuk menghasilkan koloni yang lebih besar dan mengandungi lebih banyak sel bakteria.

Bakteria berlainan biasanya membentuk koloni yang mempunyai ciri yang berlainan. Ciri koloni bakteria pada kultur pepejal boleh diterangkan dari segi bentuk, saiz, warna dan bau. Dari segi bentuk koloni bakteria boleh berbentuk bulat yang licin atau bulat tetapi bergigi. Di samping itu terdapat pula koloni bakteria yang mempunyai bentuk rizoid dan tidak sekata atau tidak mempunayi bentuk yang konsisten. Cerapan terhadap bentuk koloni jika digabungkan denagn saiz koloni dalam medium tertentu boleh menggambarkan kumpulan bakteria yang dikulturkan. Terdapat bakteria yang mempunayi koloni yang besar, sederhana dan kecil.

Di samping itu terdapat pula koloni yang berwarna disebabkan oleh pengeluaran pigmen oleh sel sel bakteria yang dikulturkan itu. Contohnya, Seratia mercescens biasanya mengeluarkan warna merah manakala beberapa spesies Pseudomonas akan memberikan warna kehijauan atau kebiruan pada kultur. Terdapat di antara pewarnaan itu yang meresap ke dalam medium. Pigmen seperti ini adalah terdiri daripada bahan metabolit sekunder yang boleh bertindak sebagai toksin atau antibiotik.
3.2.1. Pertumbuhan Populasi Dalam Kultur Kelompok

Kultur kelompok ialah kultur yang tidak ditambah dan tidak diambil sebahagian daripada mediumnya sepanjang masa pengulturan. Ini bererti dalam kultur kelompok tiada tambahan nutrien dan tiada pembuangan bahan hasilan dilakukan sehingga akhir tempoh pengkulturan. Ini bermakna pertumbuhan berlaku dalam keadaan tertutup. Pada awal pertumbuhan medium mengandungi banyak nutrien dan sedikit sel bakteria, tetapi pada ahkir pengkulturan medium akan mengandungi banyak sel dan hasilan tetapi ketandusan nutrien. Di samping itu, faktor ruang akan menjadi penting kerana penggumpulan sel dalam ruang yang kecil akan mengakibatkan sebahagian sel tidak mendapat oksigen.

Dalam kultur kelompok yang menggunakan medium cecair seperti kaldu nutrien, pertumbuhan ataupun pertambahan bilangan sel bakteria adalah dalam bentuk lengkok pertumbuhan setahap. Lengkuk pertumbuhan populasi setahap ini boleh dibahagikan kepada empat fasa iaitu, fasa lag, fasa log, fasa datar, dan fasa mati. Untuk E. coli yang dikulturkan dalam keadaan optimum, jangka masa untuk setiap tahap ialah 3-10 minit.

Pertumbuhan populasi dapat dibahagikan kepada beberapa fasa, iaitu fasa lag, fasa eksponen (fasa log), fasa datar dan fasa mati. Dalam fasa lag tiada pertambahan sel berlaku walaupun pertumbuhan individu masih berjalan. Ini bermakna sel-sel dalam fasa ini adalah aktif dari segi sintesis molekul protein, asid nukleus, peptidoglikan, dan molekul molekul lain yang diperlukan untuk membentuk sel sel baru. Fenomenon yang paling ketara dalam fasa ini ialah saiz sel sel bakteria yang lebih besar berbanding sel sel dalam fasa log.
Dalam fasa ini tidak terdapat pembahagian sel, tetapi hanyalah persediaan untuk pembahagian sahaja.

Dalam fasa log sel sel mula membahagi dengan cepat. Setelah 3, 4, 5 (dan seterusnya) kali mengganda, setiap sel akan menjadi 8, 16, 32 sel (dan seterusnya). Oleh itu, sekiranya setiap sel mengganda sebanyak 'n' kal, maka jumlah sel yang diperoleh ialah 2(ganda n) sel. Dalam kata lain, jika satu sel telah membahagi sebanyak 'n' generasi maka jumlah sel yang dihasilkan ialah 2(ganda n sel). Jika 'n' bernilai 5, maka setiap sel bakteria daripada populasi itu, telah menjadi 2 x 2 x 2 x 2 x 2, iaitu 32 sel. Jika bilangan asal sel ialah 104, maka populasi bakteria selepas 5 generasi ialah 3.2 x 10(ganda 5) atau 320,000 sel.
Dalam kultur kelompok, pertumbuhan populasi tidak boleh berada dalam fasa log secara berterusan. Setelah beberapa jam kandungan ribosom dalam sel sel itu berkurangan. Ini bermakna sintesis protein akan berkurangan dan seterusnya penurunan sintesis RNA dan DNA, dan seterusnya akan melambatkan pembahagian sel. Hasil sampingan metabolisme bakteria akan juga bertindak sebagai bahan toksik yang boleh menyebabkan kematian sel sel. Apabila kadar pertambahan sel menjadi sama dengan kadar kematian sel, maka bilangan sel akan menjadi pegun untuk beberapa ketika. Jika bilangan sel dan masa pengeraman dikaitkan dengan graf maka pertumbuhan bakteria itu akan berbentuk datar. Dengan itu nyatalah bahawa dalam keadaan sebenar, bakteria dan juga mikroorganisma lain tidak boleh membiak terus hingga memenuhi bumi.

Apakah akibatnya jika sel terus membiak dengan kadar logarithme ini? Andaikan bakteria mempunyai masa generasi 20 minit, maka dalam masa satu jam bakteria akan mendua sebanyak tiga kali, dan dalam masa 48 jam, jumlah pembahagian yang berlaku (bilangan generasi) ialah 144 kali. Oleh itu jumlah sel yang dihasilkan ialah 2144 ataupun 1043. Jika satu sel bakterium beratnya 10 12 gram maka jumlah berat sel sel bakteria yang dihasilkan setelah 48 jam ialah 1043 12 atau 1031 gram. Ini adalah lebih berat daripada 4000 kali ganda berat bumi.

Selepas beberapa lama dalam keadaan fasa datar, hasil sampingan metabolisme akan mengumpul dengan lebih banyak. Ini akan meningkatkan bilangan sel sel bakteria yang mati dan menjalani lisis. Tambahan pula, dalam keadaan kehabisan nutrien, pembahagian dan penambahan sel sel akan berhenti. Kedua dua fenomenon ini akan menyebabkan berkurangnya bilangan sel dalam kultur itu. Hasilnya ialah lengkuk yang menurun yang disebut sebagai fasa mati. Istilah yang digunakan untuk kultur yang berada dalam fasa ini ialah kultur tua, sedangkan kultur dalam masa awal dan pertengahan fasa Log disebut sebagai kultur muda. Sel sel dalam kultur tua mempunyai mekanisme pembaikan yang rendah terhadap kerosakan sel.

Posted at 11:13 am by ismad
 

Thursday, October 08, 2009
Berfikir Untuk Berjaya (1)



Mengasah Otak Untuk Berfikir


Otak manusia mempunyai berbilion sel yang boleh digunakan untuk mengintrepretasi sesuatu benda dan keadaan. Sel-sel ini disediakan untuk mengintrepretasi rangsangan dari enam indera, iaitu penglihatan, pendengaran, rasa, sentuhan, bau, dan intuasi. Dalam setiap keadaan otak akan melakukan intrepretasi rangsangan melalui analisis dan ingatan secara spontan.

Misalanya, jika seseorang terbau akan enak kari ayam, sedangkan dia tidak nampak kari ayam yang dimasak oleh jiran sebelah rumah itu, otaknya akan menganalisis bau itu dan merujuk kepada 'database' yang tersimpan di dalam sel otak. Kemudian individu itu akan merumuskan bahawa bau itu ialah bau kari ayam.

Tetapi kebanyakan individu hanya menggunakan otak dalam situasi harian seperti itu sahaja. Ini menyebabkan individu dikatakan hanya menggunakan 1% sahaja daripada potensi keupayaan otaknya.

Oleh itu, individu patut melakukan sesuatu untuk menggunakan otak yang dianugerahkan kepadanya untuk mengintrepretasi keadaan lebih dari urusan harian sahaja. Mereka perlu belatih, supaya dapat menyahut tuntutan Al-Quran seperti ayat-ayat yang menekankan pemikiran seperti "tidakkah kamu berfikir?".

Salah satu latihan ialah melihat ragam atau pattern. Contohnya, jika anda diberikan satu senarai barangan atau angka yang banyak, cuba perhatikan senarai itu dan lakukan penyususnan berdasarkan kesamaan dan kelaian untuk membetuk pelbagai ragam atau pattern bagi mengkelompokkan setiap barangan atau angka dalam senarai itu. Apakah akan jadi pada daya pemikiran anda jika anda lakukan latihan ini selalu?

Posted at 07:27 am by ismad
 

Tuesday, September 29, 2009
Mikrobilogi Asas (5)


BAB 3 Pengkulturan dan Pertumbuhan Bakteria



3.1. Pengkulturan dan pensubkulturan

Pengkulturan meliputi dua aspek, iaitu pengasingan mikroorgasima daripada sampel dan pensubkulturan kultur terasing untuk mendapatkan kultur tulen. Pengasingan bakteria dan pensubkulturan dari satu piring petri kultur kepada piring petri kultur yang baru perlu dilakukan dengan kaedah aseptik atau kaedah steril itu. Prinsip kaedah aseptik ini ialah untuk menghindarkan kemasukan bakteria ke dalam sistem kajia selain daripada bakteria yang dikaji. Maksudnya jika piring petri beragar agar digunakan sebagai bagi mengkulturkan bakteria, maka piring tersebut perlu dilindungi daripada dikontaminasi oleh mikroorganisma yang terdapat pada sekitaran.

3.1.1 Medium medium Pertumbuhan

Teknik asas pengkulturan untuk bakteria ialah pencoretan pada medium pepejal yang dibentuk oleh agar agar dalam piring petri. Selain daripada penggunaan medium pepejal, medium cecair yang disebut kaldu boleh juga digunakan untuk pengkulturan bakteria. Penggunaan sesuatu jenis medium bergantung pada tujuan kajian dan juga jenis mikroorganisma yang digunakan.

Dari segi kandungan dan kegunaan terdapat pelbagai jenis medium yang digunakan untuk mengkulturkan bakteria. Secara umumnya medium boleh dikelaskan kepada tiga, iaitu medium sintetik pembatas, medium biasa dan medium selektif. Medium sintesis pembatas atau medium tertakrif biasanya diperlukan untuk mengkaji keperluan pertumbuhan mikroorganisma; medium biasa adalah medium umum atau medium kompleks; dan medium selektif digunakan untuk menghidupkan mikroorganisma tertentu sahaja walaupun sumber inokulum adalah bahan yang mengandungi banyak jenis mikroorganisma.

Medium kompleks amat mudah disediakan kerana bahan semula jadi biasanya mengandungi kesemua unsur pertumbuhan yang diperlukan. Umpamanya, Kaldu nutrein disediakan dari rebusan tripton dan ekstrak daging lembu. Medium selektif pula mungkin merupakan medium dikayakan atau medium yang telah ditambahkan bahan bahan perencat pertumbuhan bagi kebanyakan bakteria, keculai bakteria yang hendak dikulturkan.
3.1.2 Jenis-jenis Medium Pertumbuhan

3.1.2.1 Medium Biasa

Yang digolongkan sebagai medium biasa termasuklah medium yang digunakan secara rutin dan disediakan daripada bahan asli. Contohnya, agar nutrien. Medium biasa digunakan sebagai medium asas atau boleh diperkayakan dengan darah, serum atau bahan bahan lain, untuk menjadikannya medium yang sesuai untuk pertumbuah sejenis mikrob sahaja. Contohnya ialah medium Baird Parker yang selektif bagiStaphyloccus positif koagulase dan medium Bordet Geugon yang selektif untuk Bordetella pertuesis.

3.1.2.2 Medium tertakrif (Defined Medium)

Medium ini disediakan daripada bahan kimia tulen yang terdiri daripada sumber bahan karbon (seperti glukosa), sumber nitrogen bukan organik (seperti NH4Cl) dan berbagai bagai garam bukan organik. Kadangkala asid amino tertentu perlu ditambahkan bersama-sama dengan faktor pertumbuhan yang lain.

3.1.2.3. Medium selektif (Selective medium)

Medium ini mengandungi bahan bahan yang boleh merencat kesemua mikroorganisma melainkan beberapa jenis bakteria tertentu.Medium seperti ini memudahkan pemencilan spesies tertentu daripada inokulum tercampur,iaitu inokulum yang mengandungi lebih daripada satu mikroorganisma. Terdapat medium yang dibuat berasaskan keupayaan atau keperluan fisiologi. Contohnya ialah medium medium yang digunakan untuk memencilkan bakteria pengikatan nitrogen, bakteria fotosintesis, bakteria pengoksidaan NH4, bakteria penurunan SO4 dan SO2.

Posted at 03:12 pm by ismad
 

Friday, September 04, 2009
Mikrobiologi Asas (4)


2.2 Membran Sel

Membran sel adalah satu lapisan nipis yang memisahkan dinding sel dan kandungan sel (sitoplasma). Membran sel juga disebut membran plasma atau membran sitoplasma.

Struktur membran sel bakteria berbeza dari membran sel eukariot dari segi jenis kandungan fosfolipid dan protein serta ketiadaan sterol dalam membran sel prokariot (kecuali dam mikoplasma). Ketiadaan sterol ini merupakan perbezaan utama antara kedua-dua jenis sel tersebut. Satu kumpulan antibiotik, iaitu polien (contohnya, filipina, laltin dan kandisidin) bertindak terhadap komponen sterol pada membran sel eukariot. Dengan itu, antibiotik ini boleh memusnahkan sel eukariot tetapi tidak berkesan terhadap prokariot. Ini bermakna ketiadaan sterol pada membran sel prokariot atau ketiadaan dinding sel seperti dalam mikoplasma, akan menyebabkan mikroorganisma itu peka terhadap antibiotik ini.

Struktur membran plasma boleh dicerap dengan jelas dengan menggunakan mikroskop elektron. Struktur dua lapisan ini disebut sebagai unit membran untuk membezakannya dengan membran yang lebih kompleks. Komponen fosfolipid adalah struktur asas bagi semua dinding sel. Molekul fosfolipid mempunyai dua bahagian, iaitu sebelah hidrofobik dan sebelah hidrofilik. Dalam keadaan berair, bahagian hidrofilik yang bersifat ion terdapat pada bahagian permukaan luar dan berdepan dengan permukaan air. Bahagian hidrofobik yang bersifat tidak larut air terdapat pada permukaan dalam.

Kebanyakan protein pada membran adalah hidrofobik dan terbenam di dalam matriks fosfolipid. Ada juga protein yang terbenam dengan kumpulan ion fosfolipid dan bersifat hidrofilik. Struktur unit membran menjadi lebih mantap dengan adanya H2 dan ikatan hidrofilik. Kation seperti Mg2+ dan Ca2+ juga terikat pada cas negatif fosfolipid untuk mengimbangkan dan menetapkan struktur membran. Lebih kurang 40% daripada kandungan membran ialah lipid dan 60% ialah protein.


2.3 Bahagian Dalam Sel Bakteria

2.3.1 Organel

2.3.1.1 Jalinan endoplasma

Dalam sel bakteria struktur jalinan endoplasma tidak didapati. Struktur membran ini terdapat pada bahagian berhampiran dengan nukleus pada sel eukariot. Pada jalinan endoplasma kasar, terdapat ribosom yang diperlukan untuk sintesis protein. Struktur ini juga digunakan sebagai tapak bagi beberapa aktiviti enzim yang tidak terlibat dengan sintesis protein. Aktiviti aktiviti enzim yang serupa dalam sel prokariot mungkin dijalankan dalam struktur invaginasi.

2.3.1.2 Mitokondria

Pada mikroorganisma eukariot, tapak respirasi dan fosforilasi oksidatif berlaku di dalam organel khas, iaitu mitokondria. Bentuk mitokondrion berbeza tetapi pada amnya mitokondrion ber�bentuk rod 1 �m lebar dan 2-3 �m panjang. Membran yang terdapat pada mitokondria ialah membran plasma tetapi tidak mempunyai sterol seperti yang terdapat pada membran sitoplasma. Mitokondrion boleh dibahagikan kepada dua bahagian, iaitu membran dalam dan luar. Membran dalam berlipat lipat untuk membentuk struktur yang disebut sebagai krista. Struktur krista terdiri daripa�da bahan matriks yang mengandungi bintil-bintil yang merupakan tapak kepada fosforilasi oksidatif yang terlibat dalam pengangkutan elektron.

Mitokondrion juga mempunyai DNA dan ribosom 70S. Fungsi mitokondrion direncat oleh beberapa antibiotik seperti kloramfenikol dan eritromisin, tetapi tidak direncat oleh sikloheksamida yang bertindak secara spesifik terhadap ribosom organisma eukariot. Mitokondrion diperlukan oleh eukariot aerobik bagi membolehkan organisma itu menjalankan proses respirasi dalaman. Bagi mikroorganisma anaerob pula mitokondria tidak begitu diperlukan kerana proses pernafasan dalam kumpulan ini tidak memerlukan oksigen. Oleh itu, saiznya menjadi kecil.

2.3.1.3 Kloroplas

Struktur ini ialah organel yang terdapat dalam sel mikroorganisma eukariot yang mengandungi pigmen fotosintesis dan enzim enzim yang diperlukan dalam proses fotosintesis. Pigmen fotosintesis berbeza bagi alga yang berlainan tetapi mempunyai struktur lamela (Thilakoid). Pigmen pigmen fotosintesis, iaitu klorofil dan karoten terdapat di dalam matriks lipid pada membran. Kloroplas juga mengandungi DNA dan satu sistem sintesis protein yang peka terhadap perencat sintesis protein bakteria.

Dalam bakteria ungu dan bakteria hijau proses fotosintesis boleh berlaku jika sekiranya terdapat bahan klorofil. Sistem fotosintesis yang agak ringkas berlaku dalam ketiadaan oksigen dan terdapat pada membran yang terdapat pada vesikel.


2.3.2 Kandungan Sitoplasma

2.3.2.1. Bahan genom (Kromosom)

Satu daripada ciri yang membezakan sel prokariot dengan sel eukariot ialah ketiadaan bahagian nukleus di dalam sel prokariot . Sel prokariot tidak mempunyai nukleus sebenar kerana ketiadaan membran nueklus yang akan memisahkan antara sitoplasma dengan nukleus yang dikandunginya.

Molekul DNA pada prokariot terdapat sebagai suatu rantai tanpa dikelilingi oleh membran. Ukuran DNA dalam E. coli jika diluruskan boleh mencapai 1200 �m. Ini bermakna panjang bahan kromosom boleh mencapai beratus ratus kali ganda berbanding dengan saiz bakteria yang hanya berukuran 2.0 �m. Bahan DNA sel prokariot tidak mengandungi histon seperti yang terdapat pada DNA dalam sel eukariot.

Di dalam sel eukariot, nukleus dilingkungi oleh membran nukleus dan mengandungi bahan DNA dalam bentuk kromosom. Membran nukleus dalam mikroorganisma eukariot mengandungi dua lapisan unit membran.

Bahan DNA eukariot lebih kompleks daripada prokariot dan mengandungi protein histon. Membran nukleus juga mengandungi liang liang yang boleh membenarkan bahan masuk atau keluar. Liang ini penting kerana terdapat bahan bahan yang perlu dibawa masuk ke dalam nukleus dari sitoplasma atau sebaliknya, semasa pertumbuhan sel berlaku. Misalnya, RNA disintesiskan dalam nukleus tetapi ia diperlukan di luar nukleus untuk sintesis protein. Sel eukariot mungkin mempunyai lebih dari satu nukleus. Dalam protozoa, misalnya terdapat mikronukleus yang penting dalam proses meiosis, iaitu proses pembiakan seks.

Pada beberapa bakteria, DNA di luar kromosom yang disebut sebagai plasmid juga didapati. Plasmid ini membahagi secara tersendiri tanpa kawalan DNA kromosom. Tetapi ada juga plasmid yang boleh dikamilkan masuk ke dalam kromosom dan dengan itu tidak lagi boleh membahagi secara tersendiri. Plasmid boleh berpindah ke sel lain melalui proses pengkonjugatan atau transduksi. Plasmid mengandungi pelbagai gen seperti gen gen kerintangan antibiotik (Faktor R), sintesis kolisin (Faktor kolisin), pembentukan toksin, enzim metabolik dan endonuklease pembatasan atau endonuklease pengehad.

2.3.2.2 Ribosom

Ribosom terdapat di dalam sitoplasma. Pada mikroorganisma eukariot, ribosom juga terdapat pada struktur mitokondria dan kloroplas. Saiz ribosom pada sel prokariot ialah 16 x 18 nm dan disebut juga sebagai ribosom 70S. Struktur ribosom terdapat di dalam sitoplasma dan berkait rapat dengan sistem membran sel. Terdapat dua komponen ribosom, iaitu subunit kecil (30S) dan subunit besar (50S). Kedua dua subunit ini apabila bergabung mempunyai nilai pekali pengenapan 70S. Ribosom dalam eukariot adalah lebih besar berbanding dengan ribosom dalam eukariot dan disebut sebagai ribosom 80S.

Ribosom ialah tapak sintesis protein. Untuk menjalankan peranan ini, ribosom dikayakan dengan bahan RNA; ribosom bakteria mengandungi lebih kurang 80-85% daripada keseluruhan RNA dalam sel. Di samping itu, ribosom mempunyai tapak yang boleh melekat pada molekul mRNA. Sesuatu molekul mRNA yang sedang aktif dalam sintesis protein mempunyai ribosom di sepanjang rantai mRNA tersebut dan memberi bentuk rantai tasbih. Aktiviti ribosom 70S boleh direncat oleh antibiotik seperti kloramfenikol dan eritromisin, manakala ribosom sitoplasma direncat oleh sikloheksamida.

2.3.2.2 Vakuol

Vakuol atau lompang merupakan satu struktur penting bagi beberapa mikroorganisma prokariot untuk timbul pada permukaan air. Contohnya, dalam sianobakteria terdapat vakuol yang diisi oleh gas supaya bakteria itu dapat hidup pada permukaan air tasik. Vakuol seperti ini juga terdapat pada beberapa bakteria fotosintesis ungu-hijau yang hidup di dalam tasik dan kolam.

Vakuol terdapat pada bahagian sitoplasma dan berjumlah dalam lingkungan ratusan bagi satu sel dan dianggarkan meliputi 40% daripada isipadu sel. Vakuol akan pecah apabila dikenakan tekanan tinggi. Membran vakuol hanya mengandungi protein dan protein ini memberikan ciri tidak telap air dan larutan. Hanya gas sahaja yang boleh melalui membran ini. Vakuol jenis lain seperti yang terdapat pada protozoa yang membantu dalam proses fagositosis. Vakuol mengecut pula berfungsi sebagai pam untuk mengeluarkan air dari dalam sel.

2.3.2.3 Jasad kandungan

Jasad kandungan pada amnya berfungsi untuk menyimpan bahan tenaga dan keperluan pertumbuhan. Antara bahan yang disimpan termasuklah lipids, glikogen, kanji dan volutin. Bahan bahan ini diperlakan dengan lebih banyak semasa berlakunya pembahagian sel. Sel-sel yang menjadi besar sudah mempunyai cukup bahan untuk komponen dua sel anak.


Posted at 08:10 am by ismad
 

Tuesday, September 01, 2009
Mikrobilogi Asas (4)


Bab 2: Struktur dan Fungsi Sel Bakteria



Sel bakteria adalah terdiri dari sel jenis prokariot. Secara fungsinya sel prokariot adalah uniselular, dan setiap sel boleh hidup secara sendiri. Sel prokariot berbeza kerana ketiadaan membran nukleus, ketiadaan mitokondria (dan organel organel yang bermembran yang lain) dan juga ketiadaan protein histon yang berdamping dengan molekul DNA. Di samping itu dalam bakteria, dinding sel mengandungi bahan peptidoglikan berbanding dengan selulosa dalam organisma eukariot. Ciri ciri di atas menyebabkan sel prokariot membahagi secara belahan dedua berbanding dengan proses mitosis dan meiosis yang berlaku dalam sel eukariot.

Setiap sel terdiri daripada dinding sel, yang tegar dan protoplas yang dikandunginya. Protoplas pula terdiri daripada membran sel, sitoplasma dan nukleus. Dari segi kedudukan komponen sel bakteria boleh dikumpulkan kepada tiga, iaitu permukaan sel, dinding sel dan kandungan protoplas. Di dalam sitoplasma secara amnya tidak berstruktur dan tidak dan dari itu tidak terdapat organel organel seperti dalam sel eukariot. Organel hanya terdapat pada permukaan dinding sel.

Terdapat beberapa struktur yang perlu wujud pada setiap sel bakteria, iaitu membran sel, ribosom dan nukleus. Di samping itu, terdapat juga struktur yang tidak semestinya wujud pada sesuatu bakteria, iaitu flagelum, pilus, kapsul, spora dan vakuol gas. Kewujudan struktur struktur ini pada sesuatu jenis bacteria

2.1 Struktur Luaran Sel Bakteria

2.1.1 Flagelum

Flagelum (atau silium) ialah sejenis unjuran yang terdapat pada permukaan sel bakteria. Fungsi utama flagelum ialah untuk pergerakan sel bakteria. Pada amnya, flagelum berbentuk seperti benang, tetapi struktur sebenarnya struktur ini bentuk heliks. Fungsi utama flagelum ini adalah untuk menggerakkan cecair di sekitaran sel supaya melonjakkan atau memacu sel ke hadapan. Bagi organisma yang tidak motil, pergerakan ini hanya sekadar untuk menggerakkan cecair pada permukaan organisma itu sahaja. Tujuan pergerakan seperti ini mungkin berkait rapat dengan proses osmosis dan pengangkutan aktif bahan bahan dari dalam ke luar sel atau sebaliknya. Maksudnya, cecair pada sekitaran sel itu mestilah diperbaharui setiap masa agar kepekatan solute di dalam sel sentiasa lebih tinggi berbanding sekitaran.

Flagelum pada bakteria dibentuk daripada sejenis protein, iaitu flagelin. Kandungan asid amino dalam flagelin berbeza daripada protein pada sel. Perbezaan ini disebabkan oleh kandungan sulfur dan asid amino aromatik yang rendah berbanding dengan kandungan asid asid aspartik dan asid glutamik yang lebih tinggi. Flagelum bakteria juga merupakan tapak bagi antigen H. Dengan mengggunakan kaedah serologi antigan H ini telah digunakan dalam pengelasan bakteria daripada genus genus tertentu seperti Salmonella.

Secara amnya terdapat dua jenis flagelum, iaitu flagelum kutub dan flagelum tepian. Flagelum kutub ialah flagelum yang terdapat pada bahagian hujung sel bakteria. Flagelum kutub yang terdiri daripada hanya satu flagelum tunggal disebut sebagai flagelum monotrikus seperti yang terdapat pada Pseudomonas aeroginosa. Jika terdapat beberapa flagelum pada satu hujung sel bakteria, maka flagelum itu dikenali sebagai lofotrikus. Contohnya ialah flagelum yang terdapat pada Pseudomonas flourescen. Flagelum amfitrikus pula bermaksud flagelum yang terdapat pada kedua dua hujung sel bakteria seperti dalam Spirillum serpens. Flagellum tepian disebut sebagai flagelum peritrikus seperti yang terdapat dalam Proteus mirabilis.

Flagelum juga terdapat pada mikroorganisma eukariot seperti struktur seks alga, spora kulat motil dan protozoa. Flagelum pada sel eukariot adalah lebih panjang jika dibandingkan dengan yang terdapat pada sel prokariot. Struktur flagelum pada eukariot berbeza daripada yang terdapat pada prokariot.

Flagelum eukariot mengandungi dua gentian pada bahagian tengah dan dikelilingi oleh susunan sembilan pasang gentian pada bahagian luar, ini juga dikenali sebagai struktur gentian 9 + 2. Gentian ini sebenarnya satu tiub yang juga dikenali sebagai mikrotiub. Komponen utama mikrotiub ialah protein yang dinamai tubulin.

Panjang flagelum ialah lebih kurang 200 �m, tetapi silium hanya berukuran 10 �m. Silium biasanya terdapat pada protozoa daripada subfilum Ciliophora atau sebagai organisma siliat.
2.1.2 Pilus dan fimbrium

Pilus dan fimbrium ialah struktur unjuran seperti flagelum, tetapi tidak terlibat dengan pergerakan. Struktur struktur ini lebih pendek dan lebih banyak bilangannya berbanding dengan flagelum. Seperti flagelum, bilangan dan kedudukan fimbrium berbeza dalam bakteria yang berbeza. Misalnya, pada E. coli, struktur ini terdapat pada seluruh permukaan sel, tetapi pada Pseudomonas pula fimbrium hanya terdapat pada bahagian kutub. Panjang struktur ini boleh mencapai 3 �m dan berdiameter antara 5 - 10 nm.

Istilah fimbrium lazim digunakan untuk struktur pilus yang biasa tetapi istilah pilus digunakan khusus untuk pilus yang terlibat dalam pengkonjugatan dan dikenali juga sebagai pilus seks. Terdapat hanya 1 - 2 pilus seks bagi sesuatu sel bakteria. Pilus seks lebih panjang berbanding fimbrium tetapi lebih pendek daripada flagelum. Struktur pilus berlubang di sepanjang bahagian tengah dan melalui lubang inilah bahan-bahan genetik dipindahkan daripada sel penderma kepada sel penerima semasa proses konjugasi. Diameter pilus seks dilaporkan antara 25-30 nm. Pilus terdiri daripada sejenis protein yang dikenali sebagai pilin. Fimbrium dan pilus terdapat pada beberapa jenis bakteria Gram negatif seperti Enterobacteriacea dan spesies Pseudomonas.
2.1.3 Kapsul berlendir

Ada beberapa organisma prokariot yang menghasilkan lendir pada bahagian luar dinding selnya. Struktur yang terbentuk apabila bahan lendir ini disusun secara teratur, disebut sebagai kapsul tetapi apabila sedikit lendir ada, istilah yang digunakan ialah lapisan lendir. Struktur ini juga dikenali sebagai glikokaliks yang membawa maksud bahan mengandungi polisakarida di luar sel, untuk membezakannya dengan polisakarida dalam sel.

Bahan lendir ini terdiri daripada polisakarida, polipeptida atau kompleks polisakarida dan protein. Kapsul juga mengandungi kandungan air yang tinggi dan ini dipercayai dapat membantu menghalang pengeringan sel semasa kekeringan. Kapsul boleh dilihat dengan lebih jelas setelah dilakukan pewarnaan negatif dengan bahan pewarna seperti dakwat India dan nigrosin. Struktur ini berbeza antara bakteria dari segi ketebalan dan bentuknya.

Lazimnya kehadiran kapsul luaran boleh menentukan kepatogenan mikroorganisma kerana kebolehan bahan tersebut menghalang fagositosis oleh perumah. Streptococcus pneumoniae ialah contoh mikroorganisma patogen yang boleh membiak dalam bentuk berkapsul atau tanpa kapsul apabila ditumbuhkan di atas agar agar nutrien.
2.1.4. Dinding Sel

Dinding sel adalah tegar dan menentukan bentuk bakteria. Bentuk dinding sel yang tegar juga berfungsi melindungi protoplas daripada kerosakan oleh tekanan osmosis. Mikroorganisma prokariot yang tiada dinding sel seperti mikroplasma berbentuk sfera atau pleomorfik. Mikroorganisma pleumorfik ini terhindar daripada mengalami kerosakan yang terjadi kerana tekanan osmosis dengan berada dalam perumah yang mempunyai kandungan sitoplasma yang isotonik dengan kandungan sel.

Komponen peptidoglikan

Kandungan utama dinding sel bakteria ialah peptidoglikan. Peptidoglikan memberikan kekuatan mekanikal kepada dinding sel. Lapisan peptidiglikan ini tediri daripada gula dan asid amino yang terjalin secara rapi. Kandungan gula itu terdiri daripada dua jenis, iaitu N asetilglukosamina dan N-asetilmuramik. Kandungan asid amino pula terdiri daripada D-alanina, asid D-glutamik dan sama ada lisin atau asid diaminopimelik (DAP) yang merupakan bahan bahan sambungan peptida. Komponen ini disambungkan berulang ulang sehingga menjadi suatu struktur yang kukuh.

Berdasarkan tindak balas Gram, bakteria boleh dikumpulkan kepada Gram positif (G+) dan Gram negatif (G-). Dinding sel bakteria G lebih kompleks dan mempunyai struktur berlapis lapis. Pada bakteria G-, ikatan kaitan silang tidak banyak didapati, dan dalam kebanyakan kes struktur ini lebih merupakan satu lapisan tunggal yang menjadikan lapisan ini tidak tebal.

Di dalam sel bakteria G+, bilangan ikatan silang pada kumpulan ini terdapat pada kekerapan yang lebih tinggi, khususnya antara D alanina penghujung dengan salah satu asid amino pada rantai tetrapeptida atau dengan asid amino penghujung. Pada Staphylococcus aureus misalnya, ikatan antara dua asid amino ini sangat bayak didapati. Di antara keduanya pula terdapat lima molekul asid amino glisina yang bertindak sebagai jambatan penghubung rantai asid amino. Kaitan silang peptidoglikan berbeza antara spesies spesies bakteria. Dengan memahami komponen struktur dinding sel ini, maka mekanisme pewarnaan Gram akan dapat dijelaskan dengan mudah.

Komponen asid teikoik

Asid teikoik hanya terdapat pada dinding sel G+, asid teikoik mengandungi urutan gliserol fosfat dan ribitol fosfat, gula gula lain dan juga D alanina. Asid teikoik bercas negatif untuk membolehkan dinding sel mengikat ion-ion cas positif, seperti Mg2+. Selain itu bahan ini juga berfungsi untuk mengatur tindak balas enzim autolisis.

Lapisan dinding luar lipopolisakarida

Lipopolisakarida adalah bahagian paling luar dinding sel G-. Selain mengandungi fosfolipid, lapisan lipopolisakarida ini juga mengandungi lipid tambahan (Lipid A), polisakarida dan protein. Struktur kimia komponen ini berbeza antara kumpulan mikrob, tetapi lazimnya mengandungi 5-6 jenis gula.

Komponen polisakarida mengandungi dua bahagian; iaitu O polisakarida (0 antigen) dan bahagian polisakarida teras. Pada Salmonella, bahagian teras mengandungi ketodeoksioktonat, gula 7 karbon (heptosa), glukosa, galaktosa dan N asetilglukosamina. Pada bahagian O pula terdapat galaktosa, glukosa, ramnosa dan manosa (6 karbon) Abequosa. Bahagian O juga dipercayai memberikan ciri kepatogenan kepada sesuatu mikroorganisma. Endotoksin yang terkandung di dalam lapisan ini telah dilaporkan berupaya menimbulkan simptom di dalam perumah yang dijangkiti. Bagaimanapun tidak semua bakteria mempunyai komponen ini.

Pada dinding sel G- terdapat sejenis protein yang dinamai porin. Protein ini terlibat dalam pengangkutan keluar dan masuk molekul molekul kecil (sulfat, fosfat dll.). Dianggarkan terdapat lebih kurang 30 molekul porin pada satu sel. Walaupun tidak spesifik untuk sesuatu molekul tetapi bahan ini berupaya memilih dan membenarkan atau menghalang kemasukan molekul terten�tu. Kerintangan terhadap antibiotik dipercayai ada kaitan dengan porin. Antibiotik seperti penisilin yang bertindak terhadap dinding sel tidak berkesan kepada sel G berbanding dengan sel G+.

Dari segi fungsi, bahagian luar dinding sel merupakan suatu sawar bagi kemasukan bahan bahan dari luar. Sawar ini juga penting untuk mengelakkan peresapan keluar enzim- enzim yang terdapat pada ruang periplasma. Proses pengangkutan mungkin juga melibatkan molekul ATP dan bukannya disebabkan oleh kecerunan proton. Protein pengangkut jenis ini tidak terdapat pada sel G+.

Sintesis subunit dinding sel boleh direncatkan oleh beberapa antibiotik seperti penisilin dan sikloserin. Dinding sel bakteria G+ lebih mudah diuraikan oleh lisozim (enzim lisis) berbanding dengan bakteria G-. Hal ini menjadikan bakteria G- lebih rintang terhadap penisilin dan lisozim.Selain enzim lisis, lisozim juga memerlukan agen agen pengkelatan sebelum berupaya untuk menguraikan dinding sel.

Posted at 07:47 am by ismad
 

Friday, August 28, 2009
Mikrobiologi Asas (3)


                                               Virus

Virus adalah suatu jenis mikroorganisma yang sangat ringkas dan halus. Saiz virus berada pada sekitar 25nm-330nm. Secara perbandingan sainz bakteria ialah pada sekitar 500nm hingga 3000nm (atau 0.5-3.0 nm). Perbandingan saiz organisma unisel yang laian adalah seperti yang di bawaw:

Mikroorganisma Saiz (um)
Virus 0.025 - 0.33
Bakteria 0.5 - 3
Kulat (yis) 10 - 100
Protozoa 5 - 520

Berbeza dengan mikroorganisma yang lain, virus tidak dibentuk sebagai sel. Struktur virus hanya terdiri daripada dua komponen, iaitu nukleik asid dan protein. Nukleik asid berada pada bahagian dalam (teras) dan protein membentuk lapisan luaran bagi melindungi struktur nukliek asid.

Walaupun ringkas, komponen, bentuk dan saiz virus-virus adalah berbeza. Dari segi komponen, virus mungkin terdiri daripada DNA dan protein (virus berDNA) atau RNA dan protein (virus berRNA). Dari segi bentuk pula, virus boleh digulungkan sebagai virus berbentuk memanjang, sfera dan juga kompleks. Dari segi saiz pula, terdapat virus sfera yang kecil, sederhana dan besar. Virus memanjang pula ada virus memenjang yang pendek, sederhana panjang dan sangat panjang.

Walaupun halus dan ringkas, virus boleh menyebabkan penyakit yang teruk pada manusia, haiwan dan juga tumbuhan. Antara penyakit virus yang teruk melanda manusia termasuklah penyakit AIDS, selesema burung, dan SARS.

Viroid

Viroid merupakan satu agen infeksi yang amat ringkas dan terdiri daripada asid nukleik. Ia mula dilaporkan oleh T.O.Diener pada tahun 1960 an ekoran daripada hasil kajian beliau terha�dap penyakit 'potato spindle tuber'(PST) yang menyebabkan pembentukan ubi berbentuk spindle berlaku ke atas kentang. Beliau telah menunjukkan bahawa agen yang menyebabkan penyakit tersebut hanya boleh dimusnahkan oleh enzim yang memusnahkan RNA dan pada tahun 1971, kumpulan beliau menyarankan bahawa agen penyebab penyakit tersebut terdiri daripada RNA. Setahun selepas itu, Joseph Semancik dan kumpulannya, di Universiti California melaporkan agen yang sama sebagai penyebab penyakit pada pokok sitrus. Sekarang terdapat lebih kurang sedozen penyakit yang boleh dikaitkan dengan viroids.

Setakat ini, kajian menunjukkan bahawa viroid terdiri daripada hanya molekul RNA bebenang tunggal, yang mempunyai kurang daripada 400 nukleotida, iaitu satu wujudan yang lebih kecil daripada saiz genom virus. Diener telah membuat saranan bahawa kemungkinan viriod berasal daripada 'intron', iaitu bahagian RNA yang dipotong sebelum RNA pengutus (mRNA) boleh berfungsi. Saranan ini berdasarkan kepada persamaan saiz dan bentuk yang wujud antara viriod dan intron. Manakala Semancik pula berpendapat bahawa viriod ialah gen pengatur kerana ciri penyakit yang disebabkan oleh viriods biasanya ialah gangguan terhadap pertumbuhan pokok.

Walaupun penyakit penyakit yang sudah dikenal pasti disebabkan oleh viriod semuanya terdapat hanya pada tumbuhan sahaja, namun penemuan terbaru yang dibuat oleh sekumpulan penyelidik di Knoxville, Tennessse, pada tahun 1981, menun�jukkan kewujudan viriods DNA di dalam hamster yang dijangkiti oleh barah limfatik. Penemuan ini, merupakan titik tolak dalam kajian viriod yang selama ini hanya dikaitkan dengan molekul RNA dan penyakit tumbuhan.


Prion

Jika viriods merupakan bahan genetik yang infektif, prion pula merupakan zarah protein yang infektif. Stanley B. Prusiner, seorang pengkaji yang terkemuka dalam kajian prion, telah menunjukkan bahawa prion tahan kepada kepada kesan haba, sinaran dan tindakan kimia yang biasanya menyahaktifkan virus.

Wujudan ini telah ditunjukkan terdiri daripada protein kerana ciri kepekaannya terhadap enzim pengurai protein tetapi tidak peka terhadap enzim nuklease. Faktor faktor ini menunjukkan bahawa prion bukan virus atau viriod dan ini telah banyak menimbulkan persoalan tentang cara prions bereplikasi kerana dogma pusat (central dogma) dalam biologi ialah penwarisan melalui DNA dan RNA.

Pruisiner mencadangkan bahawa prions mengunakan gen gen yang ada dalam haiwan normal dan mengaktifkannya untuk menghasilkan prion dengan banyaknya. Masa ini, cerita tentang prions masih belum selesai lagi, masih banyak yang belum diketahui dan memerlukan kajian yang lebih mendalam. Walau bagaimanapun, terdapat ahli virologi yang menyarankan bahawa prion mungkin merupakan virus yang amat seni yang mempunyai kapsid protein yang amat tumpat yang menyebabkan asid nukleiknya tidak dapat dikesan. Manakala ahli virologi yang lain pula menunggu dengan penuh minat akan kejayaan pemencilan dan pencirian protein prion itu sendiri.

Setakat ini dua penyakit manusia, iaitu kuru dan Jakob Creutzfeldt dan satu penyakit haiwan, iaitu pada kambing biri biri, scrapie, telah ditunjukkan disebabkan oleh prion.

Posted at 05:52 pm by ismad
 

Monday, August 10, 2009
Mikrobiologi (2)


Bakteria

 

Bakteria adalah organisma yang terdiri daripada sel jenis prokariot. Antara jenis-jenis organisma yang ada di atas bumi ini, hanya bakteria sahaja yang dibentuk dari sel jenis ini sedangkan organisma lain terdiri daripada sel eukariot. Bakteria mempunyai bentuk tertentu. Pada amnya terdapat lima kategori bentuk bakteria iaitu, koki (atau sfera) seperti dalam Staphylococcus, rod seperti dalam Eschericia, berpilin seperti dalam Spirillum, koma seperti dalam Vibrio dan filament seperti dalam actinomyces.

Saiz bakteria walaupun kecil sangat berbeza antara atu dengan yang lain. Saiz sesuatu spesies bakteria tetap, tetapi dalam sesuatu populasi mungkin terdapat sedikit perbezaan saiz bergantung pada keadaan sekitaran dan juga fasa pertumbuhan bakteria tersebut. Saiz yang paling kerap dijumpai ialah 0.2 2.0 um (diameter bakteria berbentuk kokus) dan 2 8 um panjang (untuk bakteria berbentuk rod). Ukuran yang lebih panjang dicerap bagi bakteria berbentuk filamen. Saiz yang biasa dijumpai ialah 0.5um (garis pusat) untuk bakteria berbentuk koki dan 0.5x2 3 um bagi bakteria berbentuk rod.

Bakteria boleh berada sebagai satu sel tunggal atau satu kelompok sel. Kelompok sel bakteria ini terbentuk apabila sel yang membahagi tidak dipisahkan. Apabila sel bakteria membahagi, lazimnya ia akan masih bertaut dengan yang lainnya dan ini akan memberikan ciri tertentu untuk organisma itu. Bentuk kelompok bergantung kepada cara pembahagian berlaku. Jika pembahagian berlaku hanya pada satu satah (plane) maka bentuk rantai akan dihasilkan. Streptococcus (contoh bagi sel berbentuk kokus) misalnya menyerupai rantai panjang yang disebut streptokoki.

Bagi bakteria berbentuk rod pula, jika pembahagaian sel pada satu satah berlaku bentuk streptobasilus akan dihasilkan. Pembahagian sel pada dua satah pula akan menghasilkan bentuk tangkai buah anggur seperti dalam Staphylococcus. bentuk yang disebut sarcina (seperti dalam bakteria dari genus Sarcina) pula merupakan bentuk yang dihasiilkan apabila pembahagian sel berlaku pada tiga satah. Pembahagian cara ini menghasilkan satu blok yang terdiri daripada sutu kumpulan lapan sel berbentuk kokus.

Dahulunya, alga biru hijau di masukkan dalam kumpulan alga. Tetapi berdasarkan selnya dalah prokariot, maka ia telah dimasukkan ke dalam kumpulan bakteria. Walaupun alga biru hijau adalah uniselular, tetapi selnya boleh berkelompok dan membentuk filament yang pendek atau satu koloni. Kepentingan alga biru hijau tidak boleh dinafikan dalam ekosistem, kerana aktivitinya dalam pengikatan nitrogen dan fotosintesis. keperluan pemakanannya yang sangat ringkas membolehkan alga mengkoloni tanah baru dan juga untuk digunakan bagi menambahkan kesburan tanah tanah lembab dan berair seperti sawah padi.

 

Demikian juga dengan satu kumpulan mikroorganisma yang dahulunya digulungkan dalam kumpulan bakteria, kini telah dipisahkan menjadi satu kumpulan utama dalam pembahagian organism. Pembahagian ini adalah berasaskan kaedah biologi molekul yang diasaskan oleh Carl Woese pada tahun tujuhpuluhan. Sebelum itu pembahagian oraganisma adalah berasaskan 5 kingdom, iaitu Haiwan, Tumbuhan, Kulat, Protista dan Bakteria. Di antara 5 kingdom itu hanya Bakteria sahaja yang mempunyai sel prokariot sedangkan yang lainnya adalah terdiri daripada organism-organisma eukariot.  Pembahagian adalah berasaskan kepada ciri-ciri seperti kehadiran nukleus di dalam sel, sitoskeleton dan membrane-membran dalam sel yang membentuk organel. Sebaliknya dalam pembahagian berasas kaedah biologi molekul, iaitu membadingkan kandungan RNA ribisom, didapati  bahawa semua organism yang bersel eukariot mempunyai persamaan yang nyata, sedangkan kumpulan bakteria pula boleh dibahagiakan kepada dua kumpulan, iaitu Eubakteria dan  Archaea;  Kumpulan Archaea ini adalah asalnya satu daripada kumpulan bacteria, tetapi mempunyai ciri RNA ribosom yang sangat berlainan dengan Eubakteria. Oleh itu Carl Woese mencadangkan pembahagian organism kepada tiga Domain, iaitu Domain Eukaryota, Eubacteria, and Archaea.

 

Posted at 08:08 am by ismad
 

Thursday, August 06, 2009
Mikrobiologi (1)

 

Mikrobiologi: Pengenalan

Mikrobiologi ialah suatu bidang yang meliputi pengajian terhadap mikroorganisma dan saling tindak mikroorganisma dengan organisma lain dalam persekitaran. Soalan asas yang biasa dikemukakan oleh pelajar adalah tentang istilah mikroorganisma itu sendiri.

Definisi ringkas yang boleh diberikan adalah seperti yang berikut: Mikroorganisma ialah organisma seni, iaitu organisma yang tidak dapat dilihat dengan mata kasar. Berdasarkan definisi ini saiz ialah ciri permulaan yang diambil kira sebagai pengukur sama ada sesuatu organisma itu akan digolongkan sebagai mikroorganisma atau bukan mikroorganisma.

Walaupun demikian, mikroorganisma menunjukkan kepelbagaian yang luas dari segi saiz, struktur, kandungan dalam sel dan fungsi. Perbezaan dan persamaan antara mikroorganisma dalam ciri-ciri yang disebutkan di atas membolehkan ahli ahli mikrobiologi membezakan dan mengenalpasti mikroorganisma.

Apa itu Mikroorganisma?


Terdapat enam kumpulan organisma yang boleh disebut sebagai mikroorganisma, iaitu virus, bakteria, alga biru hijau, alga hijau, kulat dan protozoa. Walaupun mikroorganisma mempunyai struktur yang ringkas tetapi ia berupaya memberikan kesan kepada manusia dan hidupan lain. Kesan mikroorganisma terhadap hidupan lain boleh jadi membawa keburukan atau membawa kebaikan. Kesan buruk yang dibawa oleh mikroorganisma ialah peranannya dalam menyebabkan penyakit. Penyakit yang disebabkan oleh jangkitan mikroorganisma pada manusia telah banyak mengakibatkan penderitaan, kematian dan juga kerugian ekonomi. Ini adalah kerana mikroorganisma juga boleh menjangkiti haiwan ternakan dan tanaman. Tanaman yang dijangkiti mikroorganisma mengeluarkan hasil yang kurang dan rendah kualiti. Haiwan yang dijangkiti mikroorganisma pula menjadi tidak sihat dan ada juga yang mati.


Walaupun mikroorganisma lazimnya dikaitkan dengan penyakit, tetapi bilangan spesies mikroorganisma yang terlibat dengan penyakit adalah sedikit. Bahkan, banyak spesies mikroorganisma telah digunakan oleh manusia dalam menyelesaikan beberapa masalah yang dihadapi oleh manusia. Dalam bidang perubatan misalnya, penghasilan bahan sekunder yang disebut sebagai antibiotik telah dimanfaatkan bagi merawat pelbagai penyakit yang disebabkan oleh mikroorganisma patogen.


Dalam bidang pertanian pula, mikroorganisma berperanan untuk menyempurnakan kitaran biogeokimia,iaitu kitaran karbon, nitrogen, sulfur dan lain lain. Dalam industri makanan pula mikroorganisma digunakan dalam penghasilan roti, keju, tempe dan tapai dan makanan terfermentasi yang lain.

 

Dalam bahagian seterusnya saya akan menceritakan tentang ciri-ciri organisma-organisma yang gulungkan sebagai mkroorganisma tersebut.

 

Posted at 06:56 pm by ismad